后来汉室倾覆，三国战乱，葛玄删集《灵宝经诰》，精心研诵“上清”、“灵宝”诸部真经。他曾经嘱其弟子郑思远，在他死后将“上清”、“三洞”、“灵宝”中盟诸品经箓付阁皂宗坛及家门弟子，世世箓传。道教称《灵宝经箓》传自葛玄，所以后世灵宝道士都奉他为阁皂宗祖师。
葛玄受业于左慈，之后他收郑隐为徒，郑隐又收葛洪为徒，这一脉在道教史上被称为“葛仙派”，葛仙派对道教的传承与发展有着重大而深远的影响。
《三国志·吴书》记载：孙权好道术，葛玄尝与之游，得权器重，特于方山立洞玄观。孙权为了能把葛玄留在身边，打算委任他高官荣位，但葛玄不愿意接受，认为这有碍修炼。他对弟子说：将于八月十三日申时离开人世。果不其然，到了八月十三那天，他躺在床上羽化而去。弟子们为他烧香守灵，过了三天三夜，半夜突然狂风大作，蜡烛被吹灭了。风停再点燃蜡烛时，已失去了葛玄的踪影。
《三国志》记载：葛玄精于胎息，酷暑时潜入深潭能一日不出水面，且擅长符咒诸法，能隐形变化，有分身术，白虎七变等术。
北宋崇宁三年（1104年）葛玄被封为“冲应真人”；南宋淳佑六年（1246年）封“冲应孚佑真君”。道教中尊称为“常道冲应孚佑真君”，世俗尊称为“太极葛仙翁”。
至心皈命礼。
天台得道。阁皂成真。昔受东华。复传西蜀。诏命玉京金阙。位证太极仙班。慈怜拯拔于沉沦。恩念普资于苦爽。葛天氏遗风显著。勾漏令丹砂俱存。括苍任游。罗浮乃止。修简玉笥。修理金书。大悲大愿。大圣大慈。太上玉京。东吴太极。左宫仙翁。雷霆玄省。天机内相。玉虚紫灵。普化玄静。常道冲应。孚佑真君。垂恩广教。慈悲大帝。度人无量天尊。
